Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC9

OTUB2, Ubiquitin thioesterase OTUB2, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB2Q96DC9 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTUB2Q96DC9 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTUB2Q96DC9 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTUB2Q96DC9 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTUB2Q96DC9 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTUB2Q96DC9 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTUB2Q96DC9 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTUB2Q96DC9 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTUB2Q96DC9 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTUB2Q96DC9 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUB2Q96DC9 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUB2Q96DC9 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUB2Q96DC9 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUB2Q96DC9 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUB2Q96DC9 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUB2Q96DC9 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUB2Q96DC9 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUB2Q96DC9 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUB2Q96DC9 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUB2Q96DC9 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUB2Q96DC9 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUB2Q96DC9 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUB2Q96DC9 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUB2Q96DC9 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUB2Q96DC9 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUB2Q96DC9 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUB2Q96DC9 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUB2Q96DC9 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUB2Q96DC9 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUB2Q96DC9 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUB2Q96DC9 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUB2Q96DC9 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUB2Q96DC9 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUB2Q96DC9 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUB2Q96DC9 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUB2Q96DC9 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTUB2Q96DC9 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTUB2Q96DC9 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTUB2Q96DC9 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTUB2Q96DC9 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTUB2Q96DC9 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTUB2Q96DC9 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTUB2Q96DC9 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTUB2Q96DC9 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTUB2Q96DC9 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
OTUB2Q96DC9 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTUB2Q96DC9 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
OTUB2Q96DC9 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTUB2Q96DC9 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
OTUB2Q96DC9 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
OTUB2Q96DC9 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
OTUB2Q96DC9 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
OTUB2Q96DC9 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
OTUB2Q96DC9 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTUB2Q96DC9 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTUB2Q96DC9 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTUB2Q96DC9 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTUB2Q96DC9 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTUB2Q96DC9 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTUB2Q96DC9 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTUB2Q96DC9 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTUB2Q96DC9 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTUB2Q96DC9 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTUB2Q96DC9 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTUB2Q96DC9 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTUB2Q96DC9 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTUB2Q96DC9 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTUB2Q96DC9 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
OTUB2Q96DC9 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTUB2Q96DC9 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTUB2Q96DC9 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTUB2Q96DC9 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTUB2Q96DC9 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTUB2Q96DC9 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTUB2Q96DC9 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTUB2Q96DC9 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTUB2Q96DC9 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OTUB2Q96DC9 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
OTUB2Q96DC9 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OTUB2Q96DC9 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OTUB2Q96DC9 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OTUB2Q96DC9 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
OTUB2Q96DC9 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OTUB2Q96DC9 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OTUB2Q96DC9 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OTUB2Q96DC9 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OTUB2Q96DC9 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OTUB2Q96DC9 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OTUB2Q96DC9 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
OTUB2Q96DC9 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC18■□□□□ 0.47
OTUB2Q96DC9 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
OTUB2Q96DC9 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
OTUB2Q96DC9 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
OTUB2Q96DC9 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
OTUB2Q96DC9 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
OTUB2Q96DC9 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
OTUB2Q96DC9 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
OTUB2Q96DC9 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
OTUB2Q96DC9 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OTUB2Q96DC9 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms