Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GTF3C6Q969F1 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GTF3C6Q969F1 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
GTF3C6Q969F1 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
GTF3C6Q969F1 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GTF3C6Q969F1 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
GTF3C6Q969F1 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GTF3C6Q969F1 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
GTF3C6Q969F1 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GTF3C6Q969F1 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GTF3C6Q969F1 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GTF3C6Q969F1 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GTF3C6Q969F1 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GTF3C6Q969F1 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
GTF3C6Q969F1 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GTF3C6Q969F1 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GTF3C6Q969F1 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GTF3C6Q969F1 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GTF3C6Q969F1 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GTF3C6Q969F1 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GTF3C6Q969F1 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GTF3C6Q969F1 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GTF3C6Q969F1 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GTF3C6Q969F1 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GTF3C6Q969F1 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GTF3C6Q969F1 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GTF3C6Q969F1 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
GTF3C6Q969F1 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GTF3C6Q969F1 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GTF3C6Q969F1 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GTF3C6Q969F1 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GTF3C6Q969F1 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GTF3C6Q969F1 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GTF3C6Q969F1 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GTF3C6Q969F1 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GTF3C6Q969F1 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
GTF3C6Q969F1 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GTF3C6Q969F1 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GTF3C6Q969F1 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GTF3C6Q969F1 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GTF3C6Q969F1 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GTF3C6Q969F1 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GTF3C6Q969F1 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GTF3C6Q969F1 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GTF3C6Q969F1 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GTF3C6Q969F1 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GTF3C6Q969F1 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GTF3C6Q969F1 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
GTF3C6Q969F1 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GTF3C6Q969F1 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GTF3C6Q969F1 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GTF3C6Q969F1 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
GTF3C6Q969F1 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GTF3C6Q969F1 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GTF3C6Q969F1 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GTF3C6Q969F1 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GTF3C6Q969F1 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GTF3C6Q969F1 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GTF3C6Q969F1 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
GTF3C6Q969F1 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GTF3C6Q969F1 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GTF3C6Q969F1 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GTF3C6Q969F1 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GTF3C6Q969F1 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GTF3C6Q969F1 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GTF3C6Q969F1 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GTF3C6Q969F1 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GTF3C6Q969F1 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GTF3C6Q969F1 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GTF3C6Q969F1 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GTF3C6Q969F1 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GTF3C6Q969F1 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GTF3C6Q969F1 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GTF3C6Q969F1 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GTF3C6Q969F1 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GTF3C6Q969F1 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GTF3C6Q969F1 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GTF3C6Q969F1 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GTF3C6Q969F1 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GTF3C6Q969F1 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GTF3C6Q969F1 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GTF3C6Q969F1 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GTF3C6Q969F1 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GTF3C6Q969F1 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GTF3C6Q969F1 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GTF3C6Q969F1 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GTF3C6Q969F1 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GTF3C6Q969F1 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GTF3C6Q969F1 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GTF3C6Q969F1 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GTF3C6Q969F1 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GTF3C6Q969F1 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GTF3C6Q969F1 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GTF3C6Q969F1 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GTF3C6Q969F1 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GTF3C6Q969F1 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GTF3C6Q969F1 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GTF3C6Q969F1 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GTF3C6Q969F1 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GTF3C6Q969F1 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms