Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms