Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms