Protein–RNA interactions for Protein: Q8TE77

SSH3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH3Q8TE77 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms