Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDC3

BRSK1, Serine/threonine-protein kinase BRSK1, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK1Q8TDC3 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
BRSK1Q8TDC3 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BRSK1Q8TDC3 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BRSK1Q8TDC3 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BRSK1Q8TDC3 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BRSK1Q8TDC3 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BRSK1Q8TDC3 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
BRSK1Q8TDC3 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
BRSK1Q8TDC3 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
BRSK1Q8TDC3 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BRSK1Q8TDC3 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
BRSK1Q8TDC3 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BRSK1Q8TDC3 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BRSK1Q8TDC3 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BRSK1Q8TDC3 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BRSK1Q8TDC3 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BRSK1Q8TDC3 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BRSK1Q8TDC3 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BRSK1Q8TDC3 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BRSK1Q8TDC3 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BRSK1Q8TDC3 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BRSK1Q8TDC3 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BRSK1Q8TDC3 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BRSK1Q8TDC3 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BRSK1Q8TDC3 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms