Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP4

C17orf47, Uncharacterized protein C17orf47, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf47Q8NEP4 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms