Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PIK3C3Q8NEB9 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PIK3C3Q8NEB9 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PIK3C3Q8NEB9 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PIK3C3Q8NEB9 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PIK3C3Q8NEB9 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PIK3C3Q8NEB9 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PIK3C3Q8NEB9 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PIK3C3Q8NEB9 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PIK3C3Q8NEB9 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PIK3C3Q8NEB9 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PIK3C3Q8NEB9 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PIK3C3Q8NEB9 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PIK3C3Q8NEB9 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PIK3C3Q8NEB9 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PIK3C3Q8NEB9 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PIK3C3Q8NEB9 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PIK3C3Q8NEB9 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PIK3C3Q8NEB9 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PIK3C3Q8NEB9 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PIK3C3Q8NEB9 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PIK3C3Q8NEB9 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PIK3C3Q8NEB9 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PIK3C3Q8NEB9 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PIK3C3Q8NEB9 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PIK3C3Q8NEB9 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PIK3C3Q8NEB9 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PIK3C3Q8NEB9 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PIK3C3Q8NEB9 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PIK3C3Q8NEB9 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PIK3C3Q8NEB9 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PIK3C3Q8NEB9 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PIK3C3Q8NEB9 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PIK3C3Q8NEB9 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PIK3C3Q8NEB9 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms