Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDP4

ZNF439, Zinc finger protein 439, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF439Q8NDP4 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms