Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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DTX3Q8N9I9 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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DTX3Q8N9I9 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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DTX3Q8N9I9 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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DTX3Q8N9I9 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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DTX3Q8N9I9 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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DTX3Q8N9I9 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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DTX3Q8N9I9 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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DTX3Q8N9I9 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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