Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5Q1

FAM71E2, Protein FAM71E2, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71E2Q8N5Q1 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM71E2Q8N5Q1 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM71E2Q8N5Q1 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM71E2Q8N5Q1 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM71E2Q8N5Q1 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM71E2Q8N5Q1 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM71E2Q8N5Q1 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM71E2Q8N5Q1 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM71E2Q8N5Q1 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM71E2Q8N5Q1 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM71E2Q8N5Q1 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM71E2Q8N5Q1 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM71E2Q8N5Q1 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM71E2Q8N5Q1 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM71E2Q8N5Q1 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM71E2Q8N5Q1 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM71E2Q8N5Q1 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM71E2Q8N5Q1 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM71E2Q8N5Q1 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM71E2Q8N5Q1 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM71E2Q8N5Q1 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM71E2Q8N5Q1 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM71E2Q8N5Q1 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM71E2Q8N5Q1 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM71E2Q8N5Q1 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM71E2Q8N5Q1 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM71E2Q8N5Q1 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM71E2Q8N5Q1 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM71E2Q8N5Q1 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM71E2Q8N5Q1 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM71E2Q8N5Q1 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM71E2Q8N5Q1 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM71E2Q8N5Q1 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM71E2Q8N5Q1 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM71E2Q8N5Q1 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM71E2Q8N5Q1 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM71E2Q8N5Q1 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM71E2Q8N5Q1 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM71E2Q8N5Q1 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM71E2Q8N5Q1 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM71E2Q8N5Q1 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM71E2Q8N5Q1 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM71E2Q8N5Q1 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM71E2Q8N5Q1 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM71E2Q8N5Q1 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM71E2Q8N5Q1 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM71E2Q8N5Q1 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM71E2Q8N5Q1 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM71E2Q8N5Q1 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM71E2Q8N5Q1 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM71E2Q8N5Q1 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM71E2Q8N5Q1 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM71E2Q8N5Q1 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM71E2Q8N5Q1 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM71E2Q8N5Q1 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM71E2Q8N5Q1 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM71E2Q8N5Q1 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM71E2Q8N5Q1 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM71E2Q8N5Q1 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM71E2Q8N5Q1 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM71E2Q8N5Q1 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM71E2Q8N5Q1 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM71E2Q8N5Q1 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM71E2Q8N5Q1 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM71E2Q8N5Q1 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM71E2Q8N5Q1 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM71E2Q8N5Q1 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM71E2Q8N5Q1 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM71E2Q8N5Q1 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM71E2Q8N5Q1 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms