Protein–RNA interactions for Protein: Q8N488

RYBP, RING1 and YY1-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYBPQ8N488 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RYBPQ8N488 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RYBPQ8N488 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RYBPQ8N488 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RYBPQ8N488 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RYBPQ8N488 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RYBPQ8N488 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RYBPQ8N488 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RYBPQ8N488 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RYBPQ8N488 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RYBPQ8N488 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RYBPQ8N488 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RYBPQ8N488 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RYBPQ8N488 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RYBPQ8N488 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RYBPQ8N488 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RYBPQ8N488 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RYBPQ8N488 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RYBPQ8N488 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RYBPQ8N488 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RYBPQ8N488 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RYBPQ8N488 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RYBPQ8N488 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RYBPQ8N488 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RYBPQ8N488 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RYBPQ8N488 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RYBPQ8N488 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RYBPQ8N488 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RYBPQ8N488 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RYBPQ8N488 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RYBPQ8N488 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RYBPQ8N488 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RYBPQ8N488 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RYBPQ8N488 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RYBPQ8N488 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RYBPQ8N488 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RYBPQ8N488 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RYBPQ8N488 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RYBPQ8N488 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RYBPQ8N488 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RYBPQ8N488 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RYBPQ8N488 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RYBPQ8N488 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RYBPQ8N488 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RYBPQ8N488 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RYBPQ8N488 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RYBPQ8N488 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RYBPQ8N488 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RYBPQ8N488 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RYBPQ8N488 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RYBPQ8N488 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RYBPQ8N488 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RYBPQ8N488 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RYBPQ8N488 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RYBPQ8N488 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RYBPQ8N488 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RYBPQ8N488 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RYBPQ8N488 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RYBPQ8N488 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RYBPQ8N488 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RYBPQ8N488 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RYBPQ8N488 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RYBPQ8N488 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RYBPQ8N488 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RYBPQ8N488 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RYBPQ8N488 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RYBPQ8N488 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RYBPQ8N488 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RYBPQ8N488 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RYBPQ8N488 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RYBPQ8N488 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RYBPQ8N488 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RYBPQ8N488 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RYBPQ8N488 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RYBPQ8N488 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RYBPQ8N488 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RYBPQ8N488 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RYBPQ8N488 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RYBPQ8N488 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RYBPQ8N488 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RYBPQ8N488 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RYBPQ8N488 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RYBPQ8N488 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RYBPQ8N488 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RYBPQ8N488 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RYBPQ8N488 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RYBPQ8N488 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RYBPQ8N488 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RYBPQ8N488 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RYBPQ8N488 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RYBPQ8N488 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RYBPQ8N488 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RYBPQ8N488 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RYBPQ8N488 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RYBPQ8N488 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RYBPQ8N488 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RYBPQ8N488 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RYBPQ8N488 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RYBPQ8N488 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RYBPQ8N488 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms