Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC117Q8IWD4 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms