Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms