Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z739

YTHDF3, YTH domain-containing family protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF3Q7Z739 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
YTHDF3Q7Z739 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
YTHDF3Q7Z739 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
YTHDF3Q7Z739 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
YTHDF3Q7Z739 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
YTHDF3Q7Z739 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
YTHDF3Q7Z739 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
YTHDF3Q7Z739 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
YTHDF3Q7Z739 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
YTHDF3Q7Z739 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
YTHDF3Q7Z739 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
YTHDF3Q7Z739 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
YTHDF3Q7Z739 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
YTHDF3Q7Z739 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
YTHDF3Q7Z739 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
YTHDF3Q7Z739 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
YTHDF3Q7Z739 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
YTHDF3Q7Z739 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
YTHDF3Q7Z739 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
YTHDF3Q7Z739 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
YTHDF3Q7Z739 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
YTHDF3Q7Z739 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
YTHDF3Q7Z739 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
YTHDF3Q7Z739 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
YTHDF3Q7Z739 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
YTHDF3Q7Z739 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
YTHDF3Q7Z739 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
YTHDF3Q7Z739 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
YTHDF3Q7Z739 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
YTHDF3Q7Z739 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
YTHDF3Q7Z739 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
YTHDF3Q7Z739 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
YTHDF3Q7Z739 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
YTHDF3Q7Z739 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
YTHDF3Q7Z739 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
YTHDF3Q7Z739 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
YTHDF3Q7Z739 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
YTHDF3Q7Z739 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
YTHDF3Q7Z739 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
YTHDF3Q7Z739 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
YTHDF3Q7Z739 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
YTHDF3Q7Z739 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
YTHDF3Q7Z739 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
YTHDF3Q7Z739 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
YTHDF3Q7Z739 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
YTHDF3Q7Z739 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
YTHDF3Q7Z739 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
YTHDF3Q7Z739 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
YTHDF3Q7Z739 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
YTHDF3Q7Z739 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
YTHDF3Q7Z739 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
YTHDF3Q7Z739 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
YTHDF3Q7Z739 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
YTHDF3Q7Z739 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
YTHDF3Q7Z739 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
YTHDF3Q7Z739 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
YTHDF3Q7Z739 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
YTHDF3Q7Z739 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
YTHDF3Q7Z739 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
YTHDF3Q7Z739 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
YTHDF3Q7Z739 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
YTHDF3Q7Z739 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
YTHDF3Q7Z739 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
YTHDF3Q7Z739 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
YTHDF3Q7Z739 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
YTHDF3Q7Z739 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
YTHDF3Q7Z739 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
YTHDF3Q7Z739 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
YTHDF3Q7Z739 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
YTHDF3Q7Z739 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
YTHDF3Q7Z739 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
YTHDF3Q7Z739 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
YTHDF3Q7Z739 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
YTHDF3Q7Z739 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
YTHDF3Q7Z739 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
YTHDF3Q7Z739 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
YTHDF3Q7Z739 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
YTHDF3Q7Z739 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
YTHDF3Q7Z739 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
YTHDF3Q7Z739 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
YTHDF3Q7Z739 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
YTHDF3Q7Z739 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
YTHDF3Q7Z739 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
YTHDF3Q7Z739 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
YTHDF3Q7Z739 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
YTHDF3Q7Z739 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
YTHDF3Q7Z739 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
YTHDF3Q7Z739 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
YTHDF3Q7Z739 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
YTHDF3Q7Z739 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
YTHDF3Q7Z739 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
YTHDF3Q7Z739 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
YTHDF3Q7Z739 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
YTHDF3Q7Z739 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
YTHDF3Q7Z739 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
YTHDF3Q7Z739 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
YTHDF3Q7Z739 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
YTHDF3Q7Z739 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
YTHDF3Q7Z739 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
YTHDF3Q7Z739 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms