Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z4L9

PPP1R42, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 42, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R42Q7Z4L9 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP1R42Q7Z4L9 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP1R42Q7Z4L9 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP1R42Q7Z4L9 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP1R42Q7Z4L9 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP1R42Q7Z4L9 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP1R42Q7Z4L9 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP1R42Q7Z4L9 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP1R42Q7Z4L9 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP1R42Q7Z4L9 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP1R42Q7Z4L9 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP1R42Q7Z4L9 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP1R42Q7Z4L9 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP1R42Q7Z4L9 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP1R42Q7Z4L9 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP1R42Q7Z4L9 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP1R42Q7Z4L9 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP1R42Q7Z4L9 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP1R42Q7Z4L9 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP1R42Q7Z4L9 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP1R42Q7Z4L9 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP1R42Q7Z4L9 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP1R42Q7Z4L9 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP1R42Q7Z4L9 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP1R42Q7Z4L9 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP1R42Q7Z4L9 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP1R42Q7Z4L9 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP1R42Q7Z4L9 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP1R42Q7Z4L9 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP1R42Q7Z4L9 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP1R42Q7Z4L9 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP1R42Q7Z4L9 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP1R42Q7Z4L9 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP1R42Q7Z4L9 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP1R42Q7Z4L9 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP1R42Q7Z4L9 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP1R42Q7Z4L9 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP1R42Q7Z4L9 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP1R42Q7Z4L9 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP1R42Q7Z4L9 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP1R42Q7Z4L9 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP1R42Q7Z4L9 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP1R42Q7Z4L9 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP1R42Q7Z4L9 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP1R42Q7Z4L9 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP1R42Q7Z4L9 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP1R42Q7Z4L9 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP1R42Q7Z4L9 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP1R42Q7Z4L9 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP1R42Q7Z4L9 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP1R42Q7Z4L9 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP1R42Q7Z4L9 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP1R42Q7Z4L9 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP1R42Q7Z4L9 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP1R42Q7Z4L9 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP1R42Q7Z4L9 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP1R42Q7Z4L9 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP1R42Q7Z4L9 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP1R42Q7Z4L9 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP1R42Q7Z4L9 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP1R42Q7Z4L9 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP1R42Q7Z4L9 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP1R42Q7Z4L9 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP1R42Q7Z4L9 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP1R42Q7Z4L9 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP1R42Q7Z4L9 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP1R42Q7Z4L9 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP1R42Q7Z4L9 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP1R42Q7Z4L9 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP1R42Q7Z4L9 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP1R42Q7Z4L9 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP1R42Q7Z4L9 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP1R42Q7Z4L9 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP1R42Q7Z4L9 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP1R42Q7Z4L9 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP1R42Q7Z4L9 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP1R42Q7Z4L9 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP1R42Q7Z4L9 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP1R42Q7Z4L9 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP1R42Q7Z4L9 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP1R42Q7Z4L9 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP1R42Q7Z4L9 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP1R42Q7Z4L9 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP1R42Q7Z4L9 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP1R42Q7Z4L9 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP1R42Q7Z4L9 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP1R42Q7Z4L9 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP1R42Q7Z4L9 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP1R42Q7Z4L9 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP1R42Q7Z4L9 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP1R42Q7Z4L9 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP1R42Q7Z4L9 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP1R42Q7Z4L9 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP1R42Q7Z4L9 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP1R42Q7Z4L9 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP1R42Q7Z4L9 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPP1R42Q7Z4L9 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPP1R42Q7Z4L9 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPP1R42Q7Z4L9 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPP1R42Q7Z4L9 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms