Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms