Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMIM5Q71RC9 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms