Protein–RNA interactions for Protein: Q709C8

VPS13C, Vacuolar protein sorting-associated protein 13C, humanhuman

Predictions only

Length 3,753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS13CQ709C8 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VPS13CQ709C8 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VPS13CQ709C8 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VPS13CQ709C8 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VPS13CQ709C8 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VPS13CQ709C8 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VPS13CQ709C8 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VPS13CQ709C8 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VPS13CQ709C8 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VPS13CQ709C8 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VPS13CQ709C8 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
VPS13CQ709C8 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VPS13CQ709C8 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VPS13CQ709C8 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VPS13CQ709C8 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VPS13CQ709C8 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
VPS13CQ709C8 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VPS13CQ709C8 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VPS13CQ709C8 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VPS13CQ709C8 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VPS13CQ709C8 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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VPS13CQ709C8 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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VPS13CQ709C8 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VPS13CQ709C8 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VPS13CQ709C8 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VPS13CQ709C8 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VPS13CQ709C8 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VPS13CQ709C8 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VPS13CQ709C8 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VPS13CQ709C8 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VPS13CQ709C8 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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VPS13CQ709C8 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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VPS13CQ709C8 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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VPS13CQ709C8 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VPS13CQ709C8 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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VPS13CQ709C8 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VPS13CQ709C8 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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VPS13CQ709C8 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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VPS13CQ709C8 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VPS13CQ709C8 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
VPS13CQ709C8 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VPS13CQ709C8 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VPS13CQ709C8 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VPS13CQ709C8 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VPS13CQ709C8 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VPS13CQ709C8 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VPS13CQ709C8 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
VPS13CQ709C8 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VPS13CQ709C8 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VPS13CQ709C8 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
VPS13CQ709C8 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VPS13CQ709C8 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VPS13CQ709C8 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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