Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms