Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VSTM1Q6UX27 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VSTM1Q6UX27 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VSTM1Q6UX27 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VSTM1Q6UX27 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VSTM1Q6UX27 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
VSTM1Q6UX27 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VSTM1Q6UX27 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VSTM1Q6UX27 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VSTM1Q6UX27 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VSTM1Q6UX27 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VSTM1Q6UX27 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VSTM1Q6UX27 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VSTM1Q6UX27 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VSTM1Q6UX27 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VSTM1Q6UX27 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VSTM1Q6UX27 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VSTM1Q6UX27 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VSTM1Q6UX27 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VSTM1Q6UX27 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VSTM1Q6UX27 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VSTM1Q6UX27 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VSTM1Q6UX27 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VSTM1Q6UX27 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VSTM1Q6UX27 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VSTM1Q6UX27 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VSTM1Q6UX27 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VSTM1Q6UX27 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VSTM1Q6UX27 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VSTM1Q6UX27 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VSTM1Q6UX27 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VSTM1Q6UX27 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VSTM1Q6UX27 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VSTM1Q6UX27 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VSTM1Q6UX27 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VSTM1Q6UX27 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VSTM1Q6UX27 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VSTM1Q6UX27 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VSTM1Q6UX27 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VSTM1Q6UX27 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VSTM1Q6UX27 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VSTM1Q6UX27 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
VSTM1Q6UX27 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VSTM1Q6UX27 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VSTM1Q6UX27 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
VSTM1Q6UX27 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VSTM1Q6UX27 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VSTM1Q6UX27 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
VSTM1Q6UX27 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VSTM1Q6UX27 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VSTM1Q6UX27 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VSTM1Q6UX27 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
VSTM1Q6UX27 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VSTM1Q6UX27 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VSTM1Q6UX27 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VSTM1Q6UX27 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VSTM1Q6UX27 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VSTM1Q6UX27 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VSTM1Q6UX27 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VSTM1Q6UX27 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VSTM1Q6UX27 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VSTM1Q6UX27 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VSTM1Q6UX27 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VSTM1Q6UX27 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VSTM1Q6UX27 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VSTM1Q6UX27 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VSTM1Q6UX27 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VSTM1Q6UX27 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VSTM1Q6UX27 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VSTM1Q6UX27 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VSTM1Q6UX27 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VSTM1Q6UX27 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VSTM1Q6UX27 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VSTM1Q6UX27 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VSTM1Q6UX27 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VSTM1Q6UX27 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VSTM1Q6UX27 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VSTM1Q6UX27 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VSTM1Q6UX27 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VSTM1Q6UX27 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
VSTM1Q6UX27 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
VSTM1Q6UX27 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
VSTM1Q6UX27 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VSTM1Q6UX27 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VSTM1Q6UX27 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VSTM1Q6UX27 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VSTM1Q6UX27 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VSTM1Q6UX27 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VSTM1Q6UX27 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VSTM1Q6UX27 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VSTM1Q6UX27 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VSTM1Q6UX27 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VSTM1Q6UX27 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VSTM1Q6UX27 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VSTM1Q6UX27 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VSTM1Q6UX27 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VSTM1Q6UX27 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VSTM1Q6UX27 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VSTM1Q6UX27 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
VSTM1Q6UX27 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms