Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT2

H3F3C, Histone H3.3C, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3CQ6NXT2 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H3F3CQ6NXT2 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
H3F3CQ6NXT2 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H3F3CQ6NXT2 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H3F3CQ6NXT2 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H3F3CQ6NXT2 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
H3F3CQ6NXT2 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H3F3CQ6NXT2 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H3F3CQ6NXT2 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H3F3CQ6NXT2 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H3F3CQ6NXT2 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H3F3CQ6NXT2 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H3F3CQ6NXT2 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H3F3CQ6NXT2 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H3F3CQ6NXT2 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H3F3CQ6NXT2 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H3F3CQ6NXT2 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H3F3CQ6NXT2 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H3F3CQ6NXT2 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H3F3CQ6NXT2 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H3F3CQ6NXT2 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H3F3CQ6NXT2 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H3F3CQ6NXT2 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H3F3CQ6NXT2 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H3F3CQ6NXT2 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H3F3CQ6NXT2 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H3F3CQ6NXT2 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H3F3CQ6NXT2 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H3F3CQ6NXT2 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H3F3CQ6NXT2 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H3F3CQ6NXT2 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H3F3CQ6NXT2 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H3F3CQ6NXT2 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H3F3CQ6NXT2 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H3F3CQ6NXT2 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H3F3CQ6NXT2 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H3F3CQ6NXT2 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H3F3CQ6NXT2 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H3F3CQ6NXT2 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H3F3CQ6NXT2 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H3F3CQ6NXT2 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H3F3CQ6NXT2 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
H3F3CQ6NXT2 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H3F3CQ6NXT2 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H3F3CQ6NXT2 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
H3F3CQ6NXT2 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H3F3CQ6NXT2 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H3F3CQ6NXT2 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H3F3CQ6NXT2 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H3F3CQ6NXT2 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H3F3CQ6NXT2 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H3F3CQ6NXT2 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H3F3CQ6NXT2 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H3F3CQ6NXT2 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H3F3CQ6NXT2 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H3F3CQ6NXT2 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H3F3CQ6NXT2 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H3F3CQ6NXT2 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H3F3CQ6NXT2 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H3F3CQ6NXT2 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H3F3CQ6NXT2 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H3F3CQ6NXT2 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H3F3CQ6NXT2 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H3F3CQ6NXT2 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H3F3CQ6NXT2 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H3F3CQ6NXT2 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H3F3CQ6NXT2 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H3F3CQ6NXT2 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H3F3CQ6NXT2 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H3F3CQ6NXT2 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H3F3CQ6NXT2 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H3F3CQ6NXT2 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H3F3CQ6NXT2 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H3F3CQ6NXT2 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
H3F3CQ6NXT2 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H3F3CQ6NXT2 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H3F3CQ6NXT2 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
H3F3CQ6NXT2 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H3F3CQ6NXT2 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H3F3CQ6NXT2 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H3F3CQ6NXT2 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H3F3CQ6NXT2 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
H3F3CQ6NXT2 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H3F3CQ6NXT2 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H3F3CQ6NXT2 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H3F3CQ6NXT2 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H3F3CQ6NXT2 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H3F3CQ6NXT2 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H3F3CQ6NXT2 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H3F3CQ6NXT2 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H3F3CQ6NXT2 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H3F3CQ6NXT2 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H3F3CQ6NXT2 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
H3F3CQ6NXT2 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H3F3CQ6NXT2 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H3F3CQ6NXT2 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H3F3CQ6NXT2 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H3F3CQ6NXT2 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H3F3CQ6NXT2 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H3F3CQ6NXT2 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms