Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF9

RHBDD2, Rhomboid domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD2Q6NTF9 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHBDD2Q6NTF9 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHBDD2Q6NTF9 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHBDD2Q6NTF9 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHBDD2Q6NTF9 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHBDD2Q6NTF9 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHBDD2Q6NTF9 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHBDD2Q6NTF9 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHBDD2Q6NTF9 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHBDD2Q6NTF9 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHBDD2Q6NTF9 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHBDD2Q6NTF9 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHBDD2Q6NTF9 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHBDD2Q6NTF9 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHBDD2Q6NTF9 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHBDD2Q6NTF9 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHBDD2Q6NTF9 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHBDD2Q6NTF9 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHBDD2Q6NTF9 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHBDD2Q6NTF9 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RHBDD2Q6NTF9 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHBDD2Q6NTF9 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHBDD2Q6NTF9 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHBDD2Q6NTF9 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHBDD2Q6NTF9 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHBDD2Q6NTF9 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHBDD2Q6NTF9 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHBDD2Q6NTF9 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHBDD2Q6NTF9 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHBDD2Q6NTF9 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHBDD2Q6NTF9 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHBDD2Q6NTF9 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHBDD2Q6NTF9 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHBDD2Q6NTF9 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RHBDD2Q6NTF9 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RHBDD2Q6NTF9 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHBDD2Q6NTF9 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHBDD2Q6NTF9 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RHBDD2Q6NTF9 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHBDD2Q6NTF9 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RHBDD2Q6NTF9 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHBDD2Q6NTF9 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHBDD2Q6NTF9 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHBDD2Q6NTF9 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHBDD2Q6NTF9 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RHBDD2Q6NTF9 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHBDD2Q6NTF9 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHBDD2Q6NTF9 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHBDD2Q6NTF9 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHBDD2Q6NTF9 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHBDD2Q6NTF9 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHBDD2Q6NTF9 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHBDD2Q6NTF9 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHBDD2Q6NTF9 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHBDD2Q6NTF9 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHBDD2Q6NTF9 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHBDD2Q6NTF9 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHBDD2Q6NTF9 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHBDD2Q6NTF9 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RHBDD2Q6NTF9 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RHBDD2Q6NTF9 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RHBDD2Q6NTF9 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RHBDD2Q6NTF9 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RHBDD2Q6NTF9 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHBDD2Q6NTF9 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHBDD2Q6NTF9 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHBDD2Q6NTF9 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHBDD2Q6NTF9 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHBDD2Q6NTF9 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHBDD2Q6NTF9 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHBDD2Q6NTF9 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHBDD2Q6NTF9 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHBDD2Q6NTF9 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHBDD2Q6NTF9 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHBDD2Q6NTF9 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHBDD2Q6NTF9 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHBDD2Q6NTF9 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHBDD2Q6NTF9 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHBDD2Q6NTF9 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHBDD2Q6NTF9 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHBDD2Q6NTF9 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHBDD2Q6NTF9 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHBDD2Q6NTF9 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHBDD2Q6NTF9 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHBDD2Q6NTF9 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHBDD2Q6NTF9 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHBDD2Q6NTF9 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHBDD2Q6NTF9 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHBDD2Q6NTF9 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHBDD2Q6NTF9 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHBDD2Q6NTF9 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHBDD2Q6NTF9 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHBDD2Q6NTF9 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHBDD2Q6NTF9 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHBDD2Q6NTF9 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHBDD2Q6NTF9 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHBDD2Q6NTF9 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RHBDD2Q6NTF9 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHBDD2Q6NTF9 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHBDD2Q6NTF9 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms