Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CARMIL2Q6F5E8 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CARMIL2Q6F5E8 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CARMIL2Q6F5E8 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CARMIL2Q6F5E8 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CARMIL2Q6F5E8 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CARMIL2Q6F5E8 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CARMIL2Q6F5E8 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CARMIL2Q6F5E8 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CARMIL2Q6F5E8 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CARMIL2Q6F5E8 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CARMIL2Q6F5E8 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CARMIL2Q6F5E8 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CARMIL2Q6F5E8 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CARMIL2Q6F5E8 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CARMIL2Q6F5E8 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CARMIL2Q6F5E8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CARMIL2Q6F5E8 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CARMIL2Q6F5E8 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CARMIL2Q6F5E8 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms