Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ANKRD40Q6AI12 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ANKRD40Q6AI12 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ANKRD40Q6AI12 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ANKRD40Q6AI12 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ANKRD40Q6AI12 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ANKRD40Q6AI12 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ANKRD40Q6AI12 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms