Protein–RNA interactions for Protein: Q658K8

EEF1DP3, Putative elongation factor 1-delta-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1DP3Q658K8 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms