Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms