Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXH4

PRAMEF6, PRAME family member 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF6Q5VXH4 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF6Q5VXH4 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF6Q5VXH4 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF6Q5VXH4 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF6Q5VXH4 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF6Q5VXH4 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF6Q5VXH4 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF6Q5VXH4 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF6Q5VXH4 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF6Q5VXH4 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF6Q5VXH4 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF6Q5VXH4 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF6Q5VXH4 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF6Q5VXH4 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF6Q5VXH4 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF6Q5VXH4 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF6Q5VXH4 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF6Q5VXH4 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF6Q5VXH4 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF6Q5VXH4 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF6Q5VXH4 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF6Q5VXH4 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF6Q5VXH4 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF6Q5VXH4 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF6Q5VXH4 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF6Q5VXH4 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF6Q5VXH4 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF6Q5VXH4 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF6Q5VXH4 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF6Q5VXH4 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF6Q5VXH4 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF6Q5VXH4 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF6Q5VXH4 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF6Q5VXH4 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF6Q5VXH4 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF6Q5VXH4 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF6Q5VXH4 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF6Q5VXH4 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF6Q5VXH4 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF6Q5VXH4 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF6Q5VXH4 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF6Q5VXH4 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF6Q5VXH4 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF6Q5VXH4 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF6Q5VXH4 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF6Q5VXH4 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF6Q5VXH4 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF6Q5VXH4 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF6Q5VXH4 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF6Q5VXH4 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF6Q5VXH4 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF6Q5VXH4 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF6Q5VXH4 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF6Q5VXH4 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF6Q5VXH4 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF6Q5VXH4 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF6Q5VXH4 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF6Q5VXH4 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF6Q5VXH4 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF6Q5VXH4 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF6Q5VXH4 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF6Q5VXH4 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF6Q5VXH4 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF6Q5VXH4 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF6Q5VXH4 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF6Q5VXH4 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF6Q5VXH4 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF6Q5VXH4 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF6Q5VXH4 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF6Q5VXH4 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF6Q5VXH4 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF6Q5VXH4 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF6Q5VXH4 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF6Q5VXH4 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF6Q5VXH4 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF6Q5VXH4 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF6Q5VXH4 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF6Q5VXH4 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF6Q5VXH4 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF6Q5VXH4 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF6Q5VXH4 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF6Q5VXH4 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF6Q5VXH4 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF6Q5VXH4 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF6Q5VXH4 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF6Q5VXH4 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF6Q5VXH4 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF6Q5VXH4 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF6Q5VXH4 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF6Q5VXH4 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF6Q5VXH4 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF6Q5VXH4 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF6Q5VXH4 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF6Q5VXH4 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF6Q5VXH4 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF6Q5VXH4 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF6Q5VXH4 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF6Q5VXH4 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF6Q5VXH4 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF6Q5VXH4 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
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