Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTW2

CEP78, Centrosomal protein of 78 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP78Q5JTW2 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms