Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms