Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFT2D3Q587I9 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms