Protein–RNA interactions for Protein: Q4VNC1

ATP13A4, Probable cation-transporting ATPase 13A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A4Q4VNC1 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP13A4Q4VNC1 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ATP13A4Q4VNC1 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ATP13A4Q4VNC1 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP13A4Q4VNC1 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP13A4Q4VNC1 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP13A4Q4VNC1 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP13A4Q4VNC1 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP13A4Q4VNC1 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms