Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms