Protein–RNA interactions for Protein: Q30201

HFE, Hereditary hemochromatosis protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HFEQ30201 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HFEQ30201 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HFEQ30201 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HFEQ30201 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HFEQ30201 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HFEQ30201 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HFEQ30201 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HFEQ30201 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HFEQ30201 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HFEQ30201 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HFEQ30201 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HFEQ30201 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HFEQ30201 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HFEQ30201 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HFEQ30201 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HFEQ30201 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HFEQ30201 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HFEQ30201 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HFEQ30201 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HFEQ30201 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HFEQ30201 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HFEQ30201 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HFEQ30201 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HFEQ30201 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HFEQ30201 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HFEQ30201 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HFEQ30201 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HFEQ30201 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HFEQ30201 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HFEQ30201 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HFEQ30201 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HFEQ30201 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HFEQ30201 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HFEQ30201 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HFEQ30201 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HFEQ30201 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HFEQ30201 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HFEQ30201 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HFEQ30201 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HFEQ30201 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HFEQ30201 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HFEQ30201 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HFEQ30201 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HFEQ30201 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HFEQ30201 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HFEQ30201 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HFEQ30201 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HFEQ30201 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HFEQ30201 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HFEQ30201 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HFEQ30201 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HFEQ30201 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HFEQ30201 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HFEQ30201 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HFEQ30201 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HFEQ30201 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HFEQ30201 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HFEQ30201 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HFEQ30201 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HFEQ30201 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HFEQ30201 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HFEQ30201 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HFEQ30201 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HFEQ30201 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HFEQ30201 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HFEQ30201 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HFEQ30201 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HFEQ30201 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HFEQ30201 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HFEQ30201 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HFEQ30201 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HFEQ30201 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HFEQ30201 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HFEQ30201 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HFEQ30201 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HFEQ30201 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HFEQ30201 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HFEQ30201 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HFEQ30201 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HFEQ30201 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HFEQ30201 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HFEQ30201 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HFEQ30201 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HFEQ30201 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HFEQ30201 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HFEQ30201 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HFEQ30201 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HFEQ30201 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HFEQ30201 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HFEQ30201 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HFEQ30201 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HFEQ30201 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HFEQ30201 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HFEQ30201 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HFEQ30201 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HFEQ30201 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HFEQ30201 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HFEQ30201 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HFEQ30201 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HFEQ30201 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms