Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms