Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
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