Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
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