Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms