Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms