Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC85BQ15834 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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