Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
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