Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZNHIT3Q15649 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms