Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
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