Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

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Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBE3CQ15386 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBE3CQ15386 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
UBE3CQ15386 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBE3CQ15386 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBE3CQ15386 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBE3CQ15386 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBE3CQ15386 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBE3CQ15386 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBE3CQ15386 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBE3CQ15386 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBE3CQ15386 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBE3CQ15386 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBE3CQ15386 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBE3CQ15386 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBE3CQ15386 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBE3CQ15386 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBE3CQ15386 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBE3CQ15386 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBE3CQ15386 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBE3CQ15386 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBE3CQ15386 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBE3CQ15386 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
UBE3CQ15386 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBE3CQ15386 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
UBE3CQ15386 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBE3CQ15386 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBE3CQ15386 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
UBE3CQ15386 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBE3CQ15386 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBE3CQ15386 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBE3CQ15386 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBE3CQ15386 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBE3CQ15386 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBE3CQ15386 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBE3CQ15386 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBE3CQ15386 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBE3CQ15386 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBE3CQ15386 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBE3CQ15386 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
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UBE3CQ15386 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBE3CQ15386 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBE3CQ15386 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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UBE3CQ15386 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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UBE3CQ15386 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
UBE3CQ15386 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
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UBE3CQ15386 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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UBE3CQ15386 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBE3CQ15386 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBE3CQ15386 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBE3CQ15386 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBE3CQ15386 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBE3CQ15386 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBE3CQ15386 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBE3CQ15386 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBE3CQ15386 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBE3CQ15386 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBE3CQ15386 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBE3CQ15386 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBE3CQ15386 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBE3CQ15386 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBE3CQ15386 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBE3CQ15386 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBE3CQ15386 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBE3CQ15386 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBE3CQ15386 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBE3CQ15386 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBE3CQ15386 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBE3CQ15386 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
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