Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms