Protein–RNA interactions for Protein: Q15118

PDK1, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK1Q15118 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms