Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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BRD3Q15059 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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BRD3Q15059 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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BRD3Q15059 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
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BRD3Q15059 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
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