Protein–RNA interactions for Protein: Q15025

TNIP1, TNFAIP3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP1Q15025 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms