Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 UBE2Q2P6-202ENST00000617217 443 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LAPTM4AQ15012 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
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