Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
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